北海道
| 大学／機関名 | 研究科等 | 専攻・学科 | 主宰者 | |
|---|---|---|---|---|
| 北海道大学 | 大学院理学研究院 | 化学部門 | 量子化学研究室 | 武次徹也 |
| 北海道大学 | 電子科学研究所／化学反応創成研究拠点WPI-ICReDD | データ数理 | 小松崎民樹 | |
| 北海道大学 | 触媒科学研究所 | 触媒理論研究部門 | 長谷川淳也 |
東北
| 大学／機関名 | 研究科等 | 専攻・学科 | 主宰者 | |
|---|---|---|---|---|
| 東北大学 | 大学院理学研究科 | 化学専攻 | 計算分子科学研究室 | 森田明弘 |
関東
| 大学／機関名 | 研究科等 | 専攻・学科 | 主宰者 | |
|---|---|---|---|---|
| 筑波大学 | 計算科学研究センター/数理物質科学研究科 | 生命科学研究部門/物理学専攻 | 生命機能情報部門/生命物理学 | 重田育照 |
| 東京大学 | 生産技術研究所 | 機械・生体系部門 | 佐藤文俊研究室 | 佐藤文俊 |
| 東京大学 | 大学院 新領域創成科学研究科 | 物質系専攻 | 岡崎グループ | 岡崎 進 |
| 横浜市立大学 | 大学院生命ナノシステム科学研究科 | 物質システム科学専攻 | 量子物理化学研究室 | 立川仁典 |
| 上智大学 | 理工学部 | 物質生命理工学科 | 理論分子設計研究室 | 南部伸孝 |
| 中央大学 | 理工学部 | 応用化学科 | 理論化学研究室 | 森寛敏 |
| 東京女子大学 | 現代教養学部 | 数理科学科 情報理学専攻 | webサイト | 安藤耕司 |
| 日本女子大学 | 理学部 | 数物科学科 | 村岡研究室 | 村岡梓 |
| 早稲田大学 | 先進理工学部 | 化学・生命化学科 | 電子状態理論研究室 | 中井浩巳 |
| 早稲田大学 | 先進理工学研究科 | 化学・生命化学専攻 | ケム・インフォマティクス研究室 | 清野淳司 |
| 物質・材料研究機構 | エネルギー・環境材料研究拠点 | 界面計算科学グループ | 館山佳尚 | |
| 物質・材料研究機構 | ナノアーキテクトニクス材料研究センター | 量子材料分野 | 第一原理量子物性グループ | 宮崎剛 |
中部
| 大学／機関名 | 研究科等 | 専攻・学科 | 主宰者 | |
|---|---|---|---|---|
| 金沢大学 | 大学院自然科学研究科 | 数物科学専攻 | 計算分子科学研究室 | 三浦伸一 |
| 静岡大学 | 工学部 | 化学バイオ工学科 | 凝縮相系理論化学研究室 | 鳥居肇 |
| 名古屋大学 | 未来社会創造機構 | 長岡研究室 | 長岡正隆 | |
| 名古屋大学 | 大学院情報学研究科 | 複雑系科学専攻 | 物質情報論講座 | 吉田紀生・東雅大・井内哲・松本健太郎 |
| 自然科学研究機構 分子科学研究所 | 計算科学研究センター | 江原研究室 | 江原正博 |
近畿
| 大学／機関名 | 研究科等 | 専攻・学科 | 主宰者 | |
|---|---|---|---|---|
| 京都大学 | 大学院工学研究科 | 分子工学専攻 | 分子理論化学講座 | 佐藤啓文 |
| 大阪大学 | 大学院基礎工学研究科 | 物質創成専攻化学工学領域 | 量子化学工学グループ | 北河康隆 |
| 大阪大学 | 大学院基礎工学研究科 | 物質創成専攻化学工学領域 | 分子集合系化学工学グループ | 松林伸幸 |
| 大阪大学 | 大学院理学研究科 | 化学専攻 | 量子化学研究室 | 奥村光隆 |
| 大阪府立大学 | 理学系研究科 | 分子科学専攻 | 理論・計算化学研究室 | 麻田俊雄 |
| 近畿大学 | 生物理工学部 | 生命情報工学科 | 機能性生体分子システム研究室 | 宮下尚之 |
| 理化学研究所 | 計算科学研究センター | 量子系分子科学研究チーム | 中嶋隆人 | |
| 認定NPO法人 量子化学研究協会 | 研究所 | webサイト | 中辻博 |
中国四国
| 大学／機関名 | 研究科等 | 専攻・学科 | 主宰者 | |
|---|---|---|---|---|
| 広島大学 | 大学院理学研究科 | 化学専攻 | 反応有機化学 | 安倍学 |
| 広島大学 | 大学院理学研究科 | 化学専攻 | 量子化学 | 岡田和正・ 阿部穣里 |
| 広島市立大学 | 大学院情報科学研究科 | 医用情報科学専攻 | バイオ情報学研究室 | 鷹野優 |
九州沖縄
（八地方区分毎に機関番号順で記載）